知识的价值不在于占有,而在于使用。

生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

当前位置: 主页 > TCGA >

免疫基因对GEO数据下载

时间:2020-09-21 15:55来源:生信自学网 作者:刘鑫 点击:
做免疫基因对的分析文章套路,我们还要下载一个数据,就是GEO的数据

GEO数据下载

做免疫基因对的分析文章套路,我们还要下载一个数据,就是GEO的数据,我们可以通过网址进入GEO的主页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/,搜索我们需要的数据,比如我们要做胃癌的分析,所以我们输入gastric cancer survival,然后点击查询。
 
在查询到的结果里面,我们通过筛选、过滤得到32个与人有关的数据,在其中我们挑选大于100个样品的数据,我们就点进去查看,如果里面大部分都是正常的样品,那我们就排除不用,继续查找下一个,直到我们找到了合适的数据,也就是大部分是肿瘤样品的数据,我们就可以将这个数据下载下来。










下载数据时,我们需要用到的有矩阵数据和平台文件。矩阵是我们之后要用到的探针的矩阵数据,我们需要把它下载下来。


而平台文件里面有我们探针和基因的对应关系,所以我们需要吧这个文件下载下来方便做后续分析。



视频购买链接:
《免疫基因对文章套路视频》

精品课程推荐:
《GEO数据库miRNA芯片挖掘》
《甲基化肿瘤分型文章套路视频》
《TCGA肿瘤免疫细胞浸润模式挖掘》
加生信自学网群
责任编辑:伏泽
作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载!
BioWolf二维码生成器
------分隔线----------------------------
GEO芯片数据库挖掘生信视频教程
推荐内容
TCGA数据库挖掘文章套路生信视频教程
中药复方网络药理学文章套路生信视频教程